第二集中，尼奥（基努·里维斯 Keanu Reeves 饰）没有能从内部摧毁“母体”，他的身体在真实世界的飞船上陷于昏迷，思想却被困在介于“母体”和真实世界的中间地带，这个地方由“火车人”控制。墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 Laurence Fishburne 饰）和崔妮蒂（凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）等人知道了尼奥的情况，在守护天使的带领下， 找到了“火车人”的控制者梅罗纹奇，经过一番激斗，将尼奥救了出来。 此时，电子乌贼部队对锡安发起了猛烈的攻击，人类组织所有机甲战士展开顽强的抵抗，形势危在旦夕；尼奥和崔妮蒂驾驶了一艘飞船克服重重困难，到达机器城市，尼奥终于见到了机器世界的统治者“机器大帝”，双方谈判并达成了协议：尼奥除掉不受“母体”控制的史密斯，以换取锡安的和平。 在“母体”中，尼奥和史密斯展开了关系人类生死存亡的最后决斗...
母体渴望控制，先知期待变革，病毒需要吞噬，贤者盼望奇迹，人类向往超脱，救主选择牺牲。和平是文明的衍生体，变革是平衡的副作用，毁灭是战争的必然，未知是未来的希望。天空为之哭泣，大地为之颤抖，这是一场永无休止的斗争，直到一方彻底臣服，平衡失去了平衡的意义，已知毁灭未知，世界也将终结。完美的终章。沃卓斯基兄弟用三部曲完整的阐述了哲学经典问题：我是谁（尼奥，救世主，未知之数，无我之我）我从哪里来（一种设计，一种平衡，一种必然）我到哪里去（自由意志，向死而生，生生不息）。失去双眼反而看见更多，失去爱人反而一往无前，失去生命反而拯救生命，我看到了一种超越爱、生命、一切常识的能量转换，没有毁灭，就没有拯救，无法同化，就无法超越，一切皆是为所应为之事，天道，命运，宿命，阴阳，轮回，万般道法，皆在此中。牛逼。
【B+】我一直相信，《黑客帝国》之所以晦涩难懂，仅仅只是因为在如此一个宏大的世界观下，电影这种艺术形式实在是太过渺小罢了。
《黑客帝国1》还比较容易看懂，《黑客帝国2》《黑客帝国3》就很深奥了。 造物主（Architect）负责维持母体的平衡，先知则负责引导母体中的人们觉醒。 两个人的共同作用下，母体中的人类社会稳定进化，机器人也从中吸取经验。 这也是机器人“种植”人类的终极目的，并不仅仅是用人类发电，更是为了学习人类，从而实现进化。 锡安之所以存在，也是机器人故意让它存在。 机器人无法避免母体出现bug（也就是有人觉醒），所以就等他们觉醒、等他们组建反抗军。 机器人每隔一段时间就来一次大清洗，把反抗军歼灭，然后再把母体重启。 这种大清洗已经进行过5次了，这是第6次了。 前5次的结局都是反抗军全军覆没，母体重启，而尼奥的出现让世界首次出现了不同的结局——和平。 人类和机器人互利共生，共同进化。 但是这种和平又能维持多久呢？
见过太多的才子，才发现都是膜拜的傻子。 到底有多少的电影有你的影子。
纯特效视觉堆积，男女主角牵手解决末日来临，人虽死，结局完满。