柯南和小五郎等拉着大队，来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已有流传，大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底宫殿”附近潜水时，意外遇到一大群正在寻找宝物的猎人，不料其中一人突然遭鲨鱼攻击，不幸身亡！小兰和园子幸运逃难，柯南见那位猎人死状诡异，与灰原一起展开调查。 柯南认为猎人之死，跟宝藏传说有着莫大关系，他试图解开背后原因，“海底宫殿”的谜题一直系绕在他的脑海中。他找到了一组神秘名词“Jolly Roger(海盗旗)”后，满以为有所起色，猎人却突然现身，并偷走了原来发现的宝藏！小兰和园子落在猎人的魔掌之中，性命危在旦夕！隐藏于传说中的讯息是什么？“海底宫殿”有什么秘密？穿越300年时光的暗号，柯南誓要逐步解开迷题
这部。。。实在没语言了，困死不说还搞了一远古的百合，晕死
虽然有点儿狗血，但还是可以哒……
这集是07年之前所有剧场版里最差的，唉青山你在想神马。。
越来越低智了 下回看柯南得换个大脑 啊 是我老了么
剧场版终有差强人意之处、平平淡淡的看完、在结尾曲的部分的歌和画面确实很美、但是本身有点背离了柯南的精神、阿笠的冷笑话、灰原的深沉样、柯南那绕绕的童音、小五郎的傻气、一直都是柯南迷们的重中之重的看点、从上述可看、本集毫无亮点、用2个女海盗的故事渲染整体的局、唉。。